Biopolym. Cell. 2002; 18(3):219-226.
Структура та функції біополімерів
Низькочастотні Раманівські спектри
полікристалічних рибонуклеозидів
1, 2Говорун Д. М., 1Міщук Я. Р., 2Юренко Є. П.
- Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 - Національний університет «Києво-Могилянська академія»
вул. Г. Сковороди 2, Київ, Україна, 04655
Abstract
Представлено вперше отримані низькочастотні Раманівські спектри всіх чотирьох канонічних
рибонуклеозидів – аденозину, гуанозину, уридину і цитидину, а також дезокситимідину у полі-кристалічному стані при кімнатній температурі. На основі отриманих даних робиться висновок
про походження низькочастотної коливальної моди ДНК, що спостерігається в її Раманівському
спектрі на частоті ~20 см–1
.
Повний текст: (PDF, українською)
References
[1]
Sinden RR. DNA structure and function. London: Acad, press, 1994. 398 p.
[2]
Calladine CR, Drew HR. Understanding DNA. The molecule and how it works. San Diego; Toronto: Acad, press, 1997. 283 p.
[3]
Dynamics and the problem of recognition in biological macromolecules. Eds O. Jardetzky, J.-F. Lefevre. New York; London: Plenum press, 1996. 311 p.
[4]
Govorun DN, Mishchuk YaR, Zheltovsky NV. Concerning the problem on the nature of low-frequency Raman spectra of biopolymers. Biopolym Cell. 1990; 6(4):79-83.
[5]
Urabe H, Tominaga Y. Low-lying collective modes of DNA double helix by Raman spectroscopy. Biopolymers. 1982;21(12):2477-81.
[6]
Govorun DN, Mishchuk YaR, Zheltovsky NV. Low-frequency phonon raman spectra of nucleic acid constituents: pyrimidine bases. Biopolym Cell. 1990; 6(3):31-39.
[7]
Govorun DN, Mishchuk YaR, Zheltovsky NV. Low-frequency phonon Raman spectra of nucleic acid constituents: purine bases. Biopolym Cell. 1990; 6(3):24-31.
[8]
Govorun DN, Mishchuk YaR, Zheltovsky NV. Low-frequency raman spectra of some methylated components of nucleic acisds: 1-methyl derivatives of pyrimidine bases. Biopolym Cell. 1991; 7(1):55-62.
[9]
Govorun DN, Mishchuk YaR, Zheltovsky NV. Low-frequency raman spectra of some methyl-substituted components of nucleic acids: 9-methyl derivatives of pyrimidine bases. Biopolym Cell. 1991; 7(2):5-8.
[10]
Govorun DN, Danchuk VD, Mishchuk YaR, Kondratyuk IV, Zheltovsky NV. About nonplanarity and dipole nonstability of canonical nucleotide bases methylated at glycosidic nitrogen. Dopovidi Nats Akad Nauk Ukrainy. 1995;(6):117-9.
[11]
Lord RC, Thomas GJ. Raman spectral studies of nucleic acids and related molecules—I Ribonucleic acid derivatives. Spectrochimica Acta Part A: Molecular Spectroscopy. 1967;23(9):2551–91.
[12]
Espinosa-M?ller AW, Nu?ez ARB. Extended force field method and statistical mechanical model applied to large polyatomic molecules. J Mol Struct THEOCHEM. 1984;110(3-4):341–7.
[13]
Maleev VYa, Stanevich AE. [Long-wave infrared absorption spectra of crystals of nucleosides]. Optika i Spektroskopiya. 1968; 25(1):72-6.
[14]
Berreby L, Freymann R. Donnees preliminaires sur 1'etude de la liaison hydrogene dans les bases azotees et les nucleosides par cryospectroscopie dans Pinfrarouge loin tain. C r Acad Sci. 1971; 272B(13):111-4.
[15]
Nielsen OF, Lund P-A, Praestgaard E. Low frequency vibrations (20-400 cm?1) of some mononucleosides in aqueous solution. J Raman Spectrosc. 1980;9(5):286–90.
[16]
Mathlouthi M, Seuvre AM, Koenig JL. F.T.-I.R. and laser-raman spectra of cytosine and cytidine. Carbohydrate Res. 1986;146(1):1–13.
[17]
Beetz CP, Ascarelli G. The low frequency vibrations of the nucleosides: Uridine, cytidine and inosine. Determination of vibrations associated with the ribose ring. Spectrochim Acta Part A: Molecular Spectroscopy. 1980;36(6):525–34.
[18]
Hovorun DM. How structural changeability of nitrogen bases affects macroscopic properties of their crystals. Biopolym Cell. 1998; 14(5):419-27.
[19]
Mishchuk YaR, Hovorun DM. Mutually dependent intramolecular hydrogen bonds in cytidine and deoxycytidine and their stereochemical nonrigidity. Dopovidi Nats Akad Nauk Ukrainy. 1999; (5):193-9.
[20]
Eremko A.A. Self-consistent states of quasiparticles and lattice distortion in one-dimensional molecular systems. Auth Thesis... Dr fiz.-mat. nauk. Kyiv: ITF MM Bogolyubov NAS of Ukraine, 1996. 45 p.
[21]
Hovorun DM, Mishchuk YaR. Long-range interaction in DNA: new model idea and approaches. Dopovidi Nats Akad Nauk Ukrainy. 1999; (7):161-5.
